Crianças com CNG podem, às vezes, ter alterações em como o cérebro regula as horas de sono e vigília, resultando em padrões de sono severamente alterados e períodos de sono excessivo ou insuficiente. As mudanças no cérebro podem tornar um desafio melhorar o ciclo do sono. Aqui estão duas possíveis explicações para como as vias cerebrais alteradas afetam o sono:

• Pode haver um episódio durante o dia em que é difícil acordar o seu filho(a) e ele(a) apresenta baixo tônus muscular. Isso pode ocorrer especialmente durante o estágio 3 do sono não REM, que é o período mais profundo do sono. A criança pode acordar repentinamente quando o ciclo de sono termina. 
• Crianças com sono alterado causado por mudanças nas vias cerebrais também podem apresentar baixa temperatura corporal e baixa produção de hormônio tireoidiano. Esses sintomas não são a causa do sono excessivo. Em vez disso, as vias de sono-vigília cruzam a área do cérebro que regula a temperatura corporal e a produção de hormônios, tornando possível que alguns sintomas ocorram simultaneamente. 

O relógio biológico de uma pessoa regula a produção de melatonina, a quantidade e o momento em que a melatonina é liberada no corpo pode alterar o sono. O relógio é regulado principalmente pela luz, e pode haver intervenções úteis usando a luz durante as horas típicas de vigília que irão incentivar o sono noturno e aumentar a vigília diurna.

Se o aumento do sono se tornar uma preocupação contínua, a equipe médica considerará a possibilidade de causas médicas. Medicamentos podem causar aumento da sedação, algo a considerar se um novo medicamento foi adicionado recentemente. A dor pode alterar os padrões de sono, causando estado de vigília ou insônia (ou ambos). Às vezes, quando a dor é resolvida ou tratada, a criança pode simplesmente precisar recuperar o sono perdido. Também é possível que o sono insuficiente à noite resulte em mais sono durante o dia. Veja Sono – Não o Suficiente.