يرسل الجهاز العصبيُّ إشاراتٍ حسيَّةً من الأمعاء إلى الدماغ. يمكن أن تؤدِّي التغيُّرات في الجهاز العصبي إلى تغيير الإشارات المرسَلة من الأمعاء مما يسبِّب الألم. نوعٌ من أنواع الألم يسمَّى فرطَ التحسُّس الحشويّ (visceral hyperalgesia) وهو ما يطلَق على الحساسية الزائدة للألم في الأعضاء الداخلية مثل المعدة والبنكرياس أو الأمعاء. نوعٌ آخر من الألم يسمَّى الاعتلال العصبيّ المركزيّ (central neuropathic pain) وهو ألمٌ ناتجٌ عن خللٍ وظيفيٍّ في الجهاز العصبيِّ المركزيّ.

انسداد الأمعاء الوظيفيّ المتكرر أو ما يُعرف بالانسداد المعويّ الكاذب، يحدث عندما تتباطأ حركة الأمعاء بشكلٍ مفاجئٍ دون أن يكون السبب انسدادًا ميكانيكيًّا في الأمعاء. سيقوم الفريق الطبي بتقييم وجود انسدادٍ ميكانيكي. يظهر انسداد الأمعاء الوظيفيّ كانتفاخٍ شديدٍ حادٍّ في البطن مع ألم. في بعض الأحيان يكون المحفّز لهذه الحالة مرضًا حادًّا مثل عدوى المثانة أو الالتهاب الرئوي. قد تكون التغيُّرات في الجهاز العصبي أيضًا سببًا لحدوث هذه النوبات دون وجود مرضٍ حادٍّ كعاملٍ محفّز، حيث تؤثِّر هذه التغيُّرات على كيفيَّة تنظيم الجهاز العصبيِّ لحركة الأمعاء. يمكن للفريق الطبي المساعدة في إدارة نوبة انسداد الأمعاء الوظيفيّ وتحديد كيفيَّة التعامل مع النوبات المتكرِّرة في كلِّ مرَّة.

لا يوجد اختبارٌ يمكن أن يشير إلى أنَّ الجهاز العصبيّ هو سبب الألم في الجهاز الهضميّ، ولكنَّ المعلومات المستمَدَّة من تاريخ طفلك المَرضيّ يمكن أن توحي بذلك. قد يُشتبه في الألم الناتج عن الجهاز الهضميّ عندما يحدث الألم مع انتفاخٍ طبيعيٍّ أو طفيفٍ في الأمعاء ومن الأمثلة على ذلك حدوث ألمٍ مع حركة الأمعاء يليه تحسُّنٌ بعد انخفاض الانتفاخ في القولون. يحدث هذا لأنَّ التغيرات في الجهاز العصبيّ قد تخفِضُ كمِّيَّة الانتفاخ اللازمة لتحفيز إشارة الألم حتّى لو كان الانتفاخ طفيفًا. يمكن أن تقلِّل الأدوية الخاصَّة بالألم العصبيّ من هذه الإشارات غير الطبيعية للألم ويمكنها أن تقلل من تكرار وشدّة نوبات الألم، على الرَّغم من أنَّ ألمًا طفيفًا قد يستمرُّ لأنَّه لا يوجد علاجٌ يمكنه شفاءُ السَّبب وراء هذا النَّوع من الألم بشكلٍ كامل.